指甲凹陷坑洼可能由多种原因引起。比如，甲营养不良是常见原因之一，可能与缺乏维生素（如维生素A、B族维生素等）、微量元素（像铁、锌等）有关，有研究发现约30%的指甲凹陷患者存在维生素或微量元素缺乏情况。
一、疾病因素导致
银屑病： 约50%的银屑病患者会出现指甲改变，其中指甲凹陷是比较常见的表现。银屑病是一种慢性炎症性皮肤病，与免疫系统异常有关，会影响指甲的正常生长结构，导致指甲出现凹陷坑洼等改变。甲真菌病： 由皮肤癣菌等真菌感染引起，真菌侵袭指甲，会破坏指甲的角质层，使得指甲表面不平整，出现凹陷坑洼。比如红色毛癣菌感染就容易引发甲真菌病，进而导致指甲异常。
二、外伤因素影响
局部外伤： 如果手指或指甲受到过挤压、碰撞等外伤，比如重物砸到手指、被门夹到等，可能会损伤甲母质或甲床，影响指甲的正常生长，从而出现指甲凹陷坑洼的情况。一般有明确的外伤史，受伤后一段时间指甲开始出现异常改变。频繁美甲： 经常做美甲，使用的一些美甲产品中的化学物质可能会刺激指甲，长期频繁美甲会损伤指甲的表层结构，导致指甲变得脆弱、出现凹陷坑洼等问题。比如有些女性频繁去美甲店做美甲，经过一段时间后可能发现指甲状态变差，出现凹陷。
三、其他因素关联
慢性疾病： 像缺铁性贫血患者，由于身体缺乏铁元素，影响指甲的营养供应，可能会出现指甲凹陷坑洼的现象。据统计，约20%的缺铁性贫血患者会有指甲改变。还有甲状腺功能减退症患者，甲状腺激素分泌不足会影响身体的新陈代谢，也可能导致指甲出现凹陷等异常。环境因素： 长期处于干燥、寒冷或接触某些刺激性化学物质的环境中，也可能影响指甲健康，导致指甲凹陷坑洼。例如在化工厂工作的人，长期接触一些化学试剂，指甲容易受到损害而出现异常改变。