口腔扁平苔藓的治疗方法需根据病情轻重等情况综合选择，一般来说治疗方案多样。
局部药物治疗
糖皮质激素软膏： 如曲安奈德口腔软膏，可直接涂抹在病损部位，能减轻炎症、缓解疼痛，对于糜烂型的口腔扁平苔藓有较好的抗炎作用。通常每天涂抹2 - 3次。维A酸制剂： 像维A酸软膏，能调节上皮细胞的生长和分化，对口腔扁平苔藓有一定的治疗效果，但可能会有局部刺激症状，如轻度烧灼感等。
全身药物治疗
免疫抑制剂： 对于病情较严重、反复发作的患者，可能会使用硫唑嘌呤等免疫抑制剂。这类药物能抑制免疫系统的过度反应，但使用时需要密切监测血常规等指标，因为可能会引起白细胞减少等副作用。中药治疗： 一些中药方剂也可用于口腔扁平苔藓的治疗，比如六味地黄丸等，有调节机体免疫等作用，但需要在中医师的辨证论治下使用。
物理治疗
激光治疗： 采用二氧化碳激光等，对病损部位进行照射，能起到去除病损组织、促进修复的作用。不过激光治疗后要注意口腔卫生，避免感染，一般治疗后短期内要避免食用刺激性食物。冷冻治疗： 通过低温使病损组织坏死脱落，从而达到治疗目的。冷冻治疗后局部可能会出现肿胀、疼痛等反应，要注意观察恢复情况。
去除局部刺激因素
纠正不良习惯： 患者要避免吸烟、饮酒，因为烟酒刺激可能会加重口腔扁平苔藓的病情。同时要避免食用过烫、过辣等刺激性食物，以免对口腔黏膜造成进一步损伤。治疗牙体牙髓病变： 如果有龋齿、牙髓炎等牙体牙髓疾病，要及时进行治疗，因为这些病变可能会刺激口腔黏膜，导致口腔扁平苔藓不易好转甚至加重。例如有龋齿的患者要尽早补牙，牙髓炎患者要进行根管治疗等。