早晨上完厕所腰疼可能由多种原因引起，包括腰肌劳损、腰椎间盘突出症、肾结石等。
一、腰肌劳损：如果患者长时间久坐或过度劳累，容易引发腰肌劳损。其典型症状是在早晨上完厕所后出现腰疼以及乏力感。对于这种情况，患者可在医生指导下使用非甾体类抗炎药物进行治疗，如对乙酰氨基酚、布洛芬等，这些药物能有效缓解疼痛和炎症。
二、腰椎间盘突出症：这是由于腰椎间盘发生退行性改变导致的，会对相邻脊神经根产生刺激或压迫，从而引发腰部疼痛、下肢麻木等症状，且早晨时疼痛症状往往会加重。此时，患者可遵医嘱使用肌肉松弛药物进行治疗，例如乙哌立松、氯唑沙宗等，有助于缓解肌肉紧张状态。
三、肾结石：指的是晶体物质从尿液中析出并沉积于肾脏，会致使患者在早晨上完厕所后出现腰疼、血尿、恶心、呕吐等表现。对此，患者可以采取体外冲击波碎石手术进行治疗。
总之，当早晨上完厕所后出现腰疼时，要及时明确原因，并根据具体情况进行针对性的治疗。