许多疾病都可能引发全身肌肉痛，比如流感、纤维肌痛综合征、甲状腺功能减退症等。
流感
由流感病毒引起的急性呼吸道传染病，感染后除了有发热、咳嗽、流涕等呼吸道症状外，常伴有全身肌肉酸痛，这是因为病毒感染人体后，会引发免疫反应，释放一些炎性介质，刺激神经末梢导致肌肉痛，一般在发病后1 - 2天内较为明显。
纤维肌痛综合征
这是一种常见的慢性肌肉骨骼疼痛综合征，具体病因尚不明确，可能与神经内分泌、免疫系统异常等因素有关。患者会出现全身广泛的肌肉疼痛，还可能伴有疲劳、睡眠障碍等症状，疼痛通常在晨起或休息后加重。
甲状腺功能减退症
由于甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低的疾病。患者会有全身肌肉痛、乏力等表现，是因为甲状腺激素缺乏会影响肌肉的能量代谢，导致肌肉收缩和松弛功能异常。
恶性肿瘤
某些恶性肿瘤在进展过程中可能出现全身肌肉痛的症状，例如白血病，癌细胞在骨髓内大量增殖，影响正常造血功能的同时，也可能释放一些物质引起全身肌肉疼痛；还有一些实体肿瘤晚期，患者身体消耗大、营养状况差，也可能出现全身肌肉痛。