脂溢性皮炎的治疗药物选择需根据病情而定，一般常用的药物有抗真菌药物、糖皮质激素药物等。比如外用的抗真菌药物酮康唑乳膏等，对于真菌引起的脂溢性皮炎有一定效果。
外用抗真菌药物
酮康唑乳膏： 它可以抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。适用于由真菌引起的脂溢性皮炎，能缓解瘙痒、脱屑等症状。一般每天外用1 - 2次，均匀涂抹在患处。益康唑乳膏： 对皮肤癣菌、酵母菌等有抗菌活性，通过干扰真菌细胞膜的合成来发挥作用，可用于治疗脂溢性皮炎，使用时取适量药膏涂抹于清洁后的患处，每日早晚各一次。
外用糖皮质激素药物
氢化可的松乳膏： 属于中效糖皮质激素，具有抗炎、抗过敏、止痒的作用。对于炎症比较明显的脂溢性皮炎可以短期使用，能快速减轻炎症反应，但连续使用一般不宜超过2 - 3周，以免引起皮肤萎缩等不良反应。地奈德乳膏： 适用于轻度至中度的脂溢性皮炎，抗炎作用较强，局部涂抹后能减轻炎症引起的红肿、瘙痒等症状，一般每日涂抹2 - 4次，根据病情调整使用频率。
口服药物
B族维生素： 如维生素B6片，脂溢性皮炎患者往往体内B族维生素相对缺乏，补充B族维生素有助于调节皮脂腺的分泌功能。一般成人每次10 - 20毫克，每日3次口服。抗组胺药物： 对于伴有明显瘙痒的脂溢性皮炎患者，可使用氯雷他定片等抗组胺药物。氯雷他定具有选择性地对外周H1受体的持久作用，能缓解瘙痒症状，成人及12岁以上儿童一日1次，一次10毫克。但服用后可能会有乏力、头痛等不良反应，用药期间应避免驾驶车辆、操作机械等。