子宫隐隐作痛可能由多种原因引起，比如生理期时，部分女性在月经期间会出现子宫隐隐作痛的情况，一般月经来潮的1-2天较为明显，这是因为经期前列腺素分泌增加，刺激子宫收缩导致的。
妇科疾病因素
盆腔炎：女性盆腔内的器官发生炎症时，如盆腔炎，炎症刺激会引发子宫隐隐作痛，通常还可能伴有阴道分泌物增多、异味等症状。盆腔炎多发生在性活跃期的女性身上。子宫内膜异位症：子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时，就会引发子宫内膜异位症，患者会出现子宫隐隐作痛的情况，而且这种疼痛可能会在月经期间加重，还可能影响生育，约10%-15%的育龄女性患有子宫内膜异位症。
妊娠相关因素
宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，当宫外孕发生流产或破裂前，患者会感觉一侧下腹部隐隐作痛，还可能伴有少量阴道流血。宫外孕是妇科常见的急腹症之一，若不及时处理，可能会危及生命。先兆流产：怀孕早期出现子宫隐隐作痛，同时伴有少量阴道流血，可能是先兆流产的表现。多见于胚胎发育异常、孕妇内分泌异常等情况，有数据显示，约15%-20%的妊娠会发生先兆流产。
其他因素
子宫肌瘤：子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，当肌瘤较大或位置特殊时，可能会压迫周围组织，引起子宫隐隐作痛，还可能导致月经改变，如月经量增多、经期延长等。30-50岁的女性是子宫肌瘤的高发人群，约20%-30%的女性患有子宫肌瘤。肠道问题：肠道疾病也可能导致子宫部位隐隐作痛，比如肠炎，肠道炎症刺激可能会被误认为是子宫疼痛，同时还会伴有腹泻、腹痛等肠道相关症状。