要知道孕囊停止发育的原因，可从以下几方面来分析。一般来说，孕囊停止发育可能与胚胎因素有关，比如约50% - 60%的早期流产是由胚胎染色体异常导致的，这是常见的原因之一；母体因素也很关键，像孕妇患有全身性疾病，如严重感染、高热疾病等，会影响胚胎发育；孕妇内分泌异常，例如黄体功能不全，可导致孕酮分泌不足，影响孕囊着床和发育，据统计，约有20% - 30%的早期流产与黄体功能不全有关；还有免疫功能异常，自身免疫性疾病患者体内存在抗磷脂抗体等，会攻击胚胎，影响其正常发育；子宫异常方面，子宫畸形，如纵隔子宫等，会影响孕囊的生长空间；子宫黏膜下肌瘤会影响局部血供，也可能导致孕囊停止发育；环境因素也不能忽视，过多接触放射性物质、化学毒物等，如苯、甲醛等，会增加孕囊停止发育的风险。
胚胎因素：染色体异常主导
染色体数目异常： 常见的有三体、单体等情况。比如21 - 三体综合征，就是染色体数目多了一条，这种异常会严重干扰胚胎的正常发育进程，导致孕囊停止发育。染色体结构异常： 像染色体缺失、易位等，也会破坏胚胎的遗传物质平衡，影响胚胎的生长和分化，进而引发孕囊停止发育。
母体因素：多方面影响
全身性疾病影响
严重感染情况： 孕妇如果发生严重的细菌感染，如败血症等，细菌产生的毒素以及机体的炎症反应会影响胎盘的血液供应和气体交换，从而影响孕囊的营养获取，导致孕囊停止发育。例如孕妇感染风疹病毒，在妊娠早期感染可能会引起胚胎发育异常，增加孕囊停止发育的几率。高热状态： 孕妇持续高热超过一定时间，比如体温持续38.5℃以上超过24小时，会使胚胎组织代谢紊乱，影响胚胎的正常生长，导致孕囊停止发育。
内分泌异常表现
黄体功能不全详情： 黄体分泌的孕酮对维持孕囊着床和发育至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就不能为孕囊提供良好的着床和发育环境。据研究，在反复发生孕囊停止发育的孕妇中，约有20% - 30%存在黄体功能不全的情况。甲状腺功能异常： 甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响孕妇的新陈代谢以及胚胎的生长发育，可能导致孕囊停止发育；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常发育过程。
子宫异常：空间与血供问题
子宫畸形状况
纵隔子宫情况： 子宫腔内有纵隔将宫腔分成两部分，这会使孕囊的着床位置受限，而且纵隔区域的子宫肌层发育可能不完善，影响孕囊周围的血供，从而增加孕囊停止发育的风险。单角子宫情况： 只有一侧副中肾管发育，另一侧未发育或未形成管道，子宫腔相对狭窄，孕囊的生长空间有限，也容易出现孕囊停止发育的情况。
子宫黏膜下肌瘤影响
肌瘤位置与大小： 黏膜下肌瘤向宫腔内生长，会占据宫腔空间，影响孕囊的着床和生长。如果肌瘤较大，还会压迫周围的血管，影响局部的血液供应，导致孕囊缺血缺氧，进而停止发育。一般来说，直径超过5cm的黏膜下肌瘤对孕囊发育的影响更为明显。
环境因素：外部物质的危害
放射性物质接触
辐射剂量与时间： 孕妇过多接触X射线等放射性物质，当辐射剂量达到一定程度，比如接受超过100mSv的辐射剂量，或者接触时间较长时，会破坏胚胎细胞的DNA，影响胚胎的正常分裂和分化，导致孕囊停止发育。例如在放射科工作的孕妇，如果防护不当，长时间接触少量辐射，也可能增加孕囊停止发育的几率。
化学毒物接触
常见毒物种类： 像苯，它是一种有机溶剂，长期接触苯会影响孕妇的造血系统和生殖系统，进而影响胚胎发育；甲醛也是常见的有害化学物质，在新装修的房屋中甲醛含量较高，孕妇吸入后会对胚胎产生毒性作用，导致孕囊停止发育。据调查，在新装修环境中居住超过3个月的孕妇，孕囊停止发育的发生率比正常环境居住的孕妇要高约20%。