从医疗、健康角度来讲，一般建议在饭后1-2小时喝酸奶，此时饮用对身体最好。
因为在饭后1-2小时，胃酸被食物稀释，胃内的酸碱度（pH值）最适合乳酸菌生长。同时，乳酸菌还能抑制有害菌在肠内的繁殖，促进胃肠蠕动和消化液的分泌，有助于食物的消化和吸收。此外，晚上睡前喝酸奶也有一定益处，因为夜间血钙水平较低，酸奶中的钙可以补充血钙的流失，维持血钙平衡。
需要注意的是，酸奶不能空腹喝，因为空腹时胃内的胃酸较多，乳酸菌易被胃酸杀死，保健作用会减弱。另外，酸奶中的某些菌种及酸性物质对牙齿有一定的损害，喝完后应及时漱口或刷牙。