巧克力囊肿对怀孕的影响是不确定的，需依据囊肿大小与症状来剖析。
一、不影响怀孕的情况。如果巧克力囊肿形成时间短且体积小，未引发盆腔粘连，同时也不干扰卵巢正常排卵，那么通常就不会给怀孕带来影响。
二、影响怀孕的情况。若巧克力囊肿较大，致使盆腔粘连，便可能影响输卵管对卵子的拾取，进而影响怀孕。此外，巧克力囊肿若生长在卵巢上，有可能会对卵巢的排卵造成影响，因此也会影响怀孕，甚至导致不孕。
如果是巧克力囊肿影响了怀孕，可以前往医院通过腹腔镜进行根治。
总之，巧克力囊肿对怀孕的影响要具体情况具体分析，一旦发现巧克力囊肿且有怀孕计划，应及时就医，根据医生的建议进行相应的处理和治疗。