男性尿路感染主要是细菌等病原体入侵尿路引起的。比如大肠埃希菌就常是引发男性尿路感染的常见致病菌，约占尿路感染病原菌的80%左右。
尿路梗阻因素
前列腺增生： 男性到了一定年龄，比如50岁以上，前列腺增生的发病率会明显升高。增生的前列腺会压迫尿道，导致尿液排出不畅，细菌容易在残留的尿液中繁殖，从而引发尿路感染。尿路结石： 当男性泌尿系统存在结石时，比如输尿管结石、肾结石等，会阻碍尿液的正常流动，使尿液滞留，为细菌滋生创造条件，增加尿路感染的风险。
机体防御功能差
局部免疫缺陷： 男性的尿路局部免疫功能如果出现问题，比如分泌的免疫球蛋白减少等情况，就容易让细菌更容易在尿路定植并引发感染。全身抵抗力下降： 当男性患有某些全身性疾病，像糖尿病时，血糖控制不佳会使机体抵抗力降低，这时候细菌就更容易侵袭尿路导致感染；还有长期熬夜、过度劳累等情况，也会让身体抵抗力下降，增加尿路感染的易感性。
医源性因素
导尿操作： 如果男性因为病情需要进行导尿，比如长时间住院的患者需要留置导尿管，导尿过程中可能会把外界的细菌带入尿道，从而引发尿路感染。一般留置导尿管超过3天，尿路感染的发生率会大幅增加，可达90%以上。尿道器械检查： 进行尿道镜检查、膀胱镜检查等尿道器械检查时，如果操作不规范或者器械消毒不彻底，也可能导致尿道黏膜损伤，进而让细菌侵入引发感染。