睡觉半夜打喷嚏可能由多种原因引起。比如，可能是环境因素导致，像夜间室内有灰尘、花粉等过敏原，据统计，约有10% - 20%的人会因夜间接触过敏原出现打喷嚏情况。
环境因素影响
温度变化刺激： 夜间温度如果骤变，比如从温暖环境突然进入较冷环境，鼻腔黏膜受到刺激就容易打喷嚏。当室内外温差超过5℃时，这种刺激引发打喷嚏的概率会明显增加。灰尘螨虫作祟： 床上用品如果长时间不清洗，会滋生大量灰尘和螨虫，夜间人体接触到这些物质，鼻腔受到刺激就会打喷嚏。一般来说，每张床上的螨虫数量超过100只时，就比较容易引发过敏反应导致打喷嚏。
过敏性鼻炎导致
过敏原持续刺激： 如果本身是过敏性鼻炎患者，夜间睡眠时，鼻腔持续接触室内的过敏原，像尘螨、霉菌等，就会不断引发打喷嚏。这类患者在夜间打喷嚏的频率可能会比白天更高，有的甚至一晚能打十几次喷嚏。炎症反应持续： 过敏性鼻炎患者鼻腔处于炎症状态，夜间人体代谢减缓，炎症反应相对更明显，从而导致半夜频繁打喷嚏。
上呼吸道感染前期
病毒开始侵袭： 在感冒初期，病毒开始影响鼻腔，夜间人体处于休息状态，身体对病毒的防御反应在鼻腔表现为打喷嚏。一般感染初期，可能先出现偶尔打喷嚏，随后才会有其他感冒症状，如鼻塞、流涕等。免疫力相对降低： 夜间人体免疫力相对白天会有所降低，病毒更容易侵袭鼻腔，引发打喷嚏症状。