小儿肺炎支原体感染的治疗方法主要包含对因治疗与对症治疗。既要处理支原体感染引发的肺炎，也要针对小儿存在的咳嗽、痰多、缺氧等症状予以对症治疗，且用药需在医生指导下进行。
一、对因治疗：
1.常采用大环内酯类抗生素来治疗支原体感染，临床常用的有阿奇霉素或红霉素。
2.家长需注意，小儿发生支原体感染一定要进行足疗程治疗。上呼吸道感染通常治疗1周左右，下呼吸道如急性支气管炎或肺炎时，疗程需2至3周，否则易导致支原体感染反复。
二、对症治疗：
1.止咳化痰：
(1)支原体感染常伴有剧烈咳嗽，治疗时需针对咳嗽进行处理。呼吸道会产生分泌物，可应用强力枇杷露、盐酸氨溴索口服溶液等止咳化痰药物。
(2)必要时可通过雾化吸入乙酰半胱氨酸等药物使痰液稀释，然后通过拍背或吸痰促进痰液排出，以利于控制支原体感染。
2.氧疗：小儿肺炎支原体感染出现缺氧症状时应及时进行氧疗，根据缺氧程度给予吸氧或通过人工机械辅助方式给氧。
3.营养心肌治疗：
(1)小儿支原体感染，尤其发生支原体肺炎时，易并发心肌炎，此时心肌酶会明显升高。
(2)若并发心肌炎，必须及时使用营养心肌药物，如曲美他嗪、辅酶Q10、门冬氨酸钾镁片等进行治疗，同时要多休息，避免增加心脏负担。
4.应用激素：重症支原体肺炎除上述治疗外，若病情发展迅速，出现肺不张、支气管扩张、肺间质纤维化或存在肺外并发症，可能还需应用地塞米松、强的松等肾上腺皮质激素进行治疗。
此外，肺炎支原体感染可能造成小范围流行，且小儿发病后治疗时间长，对发生支原体感染或有密切接触史的小儿，应做到呼吸道隔离。当小儿发生肺炎支原体感染时，家长应及时带其前往医院就诊，并在医生指导下进行合理治疗。家长平时要注意孩子的喂养方式，注意保暖，以避免小儿肺炎复发。