扁桃体化脓是腭扁桃体的急性炎症，多由细菌或病毒感染引起。头孢克肟和阿莫西林都是抗生素，用于治疗细菌感染。但它们的作用机制和适应症略有不同，因此在治疗扁桃体化脓时，哪种药物效果更好，需要根据具体情况来判断。以下是关于扁桃体化脓时，头孢克肟和阿莫西林的效果比较：
1.作用机制：头孢克肟是第三代头孢菌素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成发挥抗菌作用。阿莫西林是广谱青霉素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成发挥抗菌作用。
2.适应症：头孢克肟主要用于治疗敏感菌引起的感染，如呼吸道感染、泌尿系统感染、皮肤软组织感染等。阿莫西林主要用于治疗敏感菌引起的感染，如呼吸道感染、泌尿系统感染、皮肤软组织感染等。扁桃体化脓是由细菌感染引起的，因此两种药物都可以用于治疗。
3.疗效：头孢克肟和阿莫西林的疗效因人而异，取决于多种因素，如患者的年龄、性别、身体状况、感染的严重程度、细菌的敏感性等。一般来说，头孢克肟的抗菌谱比阿莫西林更广，对一些耐药菌也有一定的抗菌作用。因此，在一些情况下，头孢克肟可能比阿莫西林更有效。但在某些情况下，阿莫西林可能更适合，因为它的价格相对较低，且过敏反应的发生率较低。
4.副作用：头孢克肟和阿莫西林的副作用相似，主要包括过敏反应、胃肠道反应、肝功能异常等。但头孢克肟的过敏反应发生率相对较低。
5.注意事项：在使用头孢克肟和阿莫西林时，需要注意以下事项：
过敏史：如果患者对青霉素类或头孢菌素类抗生素过敏，应避免使用。
禁忌症：对头孢克肟或阿莫西林过敏者禁用；肾功能不全者慎用。
药物相互作用：头孢克肟和阿莫西林与其他药物可能会发生相互作用，因此在使用前应告知医生正在使用的其他药物。
用药剂量：应按照医生的建议使用药物，不要自行增减剂量。
用药时间：一般需要连续使用5-7天，以确保感染得到彻底治愈。
观察副作用：在使用过程中，应注意观察是否出现副作用，如过敏反应、胃肠道反应等。如果出现严重不适，应及时就医。
综上所述，头孢克肟和阿莫西林都是治疗扁桃体化脓的有效药物，但哪种药物效果更好，需要根据具体情况来判断。在使用时，应遵循医生的建议，按照说明书的要求使用药物。同时，应注意观察副作用，如有不适，及时就医。