肛门瘙痒症的治疗需根据具体情况选择合适方法，一般可通过局部外用药物等方式改善，部分患者经过规范治疗能在较短时间内缓解症状。
局部外用药物治疗
外用止痒药膏： 常用的有糖皮质激素类药膏，如氢化可的松软膏等，这类药物可以起到抗炎、止痒的作用，但要注意长期大量使用可能会有皮肤萎缩等不良反应，一般连续使用不宜超过2周。还有钙调磷酸酶抑制剂，像他克莫司软膏，适用于不宜使用糖皮质激素的部位，比如会阴部等，不过使用初期可能会有局部灼热感等。外用洗剂： 可以用中药洗剂外洗，比如黄柏洗液等，能起到清热燥湿、止痒的效果。也可以用1:5000的高锰酸钾溶液坐浴，一般每天坐浴1 - 2次，每次15 - 20分钟，有一定的杀菌、清洁、止痒作用，但要注意浓度不能过高，以免刺激皮肤。
改善生活习惯方面
保持肛门清洁干燥： 每天要定时用温水清洗肛门部位，清洗时要注意水温适宜，一般30 - 40℃左右比较合适，清洗后要用干净柔软的毛巾轻轻擦干，避免用力擦拭刺激肛门皮肤。要选择宽松、透气的棉质内裤，勤换内裤，内裤最好每天更换并进行清洗晾晒，保持肛门局部的清洁干爽环境。避免刺激因素： 要避免食用辛辣、刺激性食物，比如辣椒、花椒、生姜等，这些食物容易导致肛门局部血管扩张，加重瘙痒症状。也要避免饮酒，酒精会刺激肛门周围皮肤，使瘙痒加剧。同时，要避免长时间久坐，尤其是坐在不透气的座位上，每隔一段时间要起身活动一下，促进肛门局部血液循环。
针对原发疾病治疗
肠道寄生虫感染： 如果是肠道寄生虫感染引起的肛门瘙痒，如蛲虫感染，需要进行驱虫治疗。蛲虫一般在夜间会爬到肛门周围产卵，导致瘙痒，这时候可以使用阿苯达唑等驱虫药物，但要注意2岁以下儿童禁用阿苯达唑，需在医生指导下选择合适的驱虫方案。肛周皮肤病： 若是由肛周湿疹、肛周银屑病等肛周皮肤病引起的肛门瘙痒，对于肛周湿疹，除了外用药物治疗外，还需要避免接触过敏原，如某些化纤材质的内裤等。如果是肛周银屑病，可能需要综合治疗，包括外用药物以及必要时的光疗等，但具体治疗方案要根据病情由医生制定。