肛周脓肿的治疗费用一般在几千元到上万元不等，具体费用与多种因素有关。
治疗方式不同费用有别
手术治疗方面： 单纯的肛周脓肿切开引流术相对费用较低，大概可能在3000~5000元左右。但如果是复杂性肛周脓肿，需要进行挂线疗法等更复杂的手术，费用会高一些，可能在10000元甚至更高。因为复杂性肛周脓肿手术操作更复杂，恢复时间可能更长，使用的材料等成本也会增加。非手术治疗情况： 如果肛周脓肿处于早期，脓肿较小，通过抗生素等非手术治疗，费用相对会低一些。但抗生素的使用也会因药物种类不同而有差异，一般使用普通抗生素进行抗感染治疗，可能花费在1000~3000元左右，但非手术治疗有时候效果不佳，还是需要手术，所以总体费用不能只算非手术部分。
地区差异影响费用
一线城市： 在一些一线城市的三甲医院，肛周脓肿的治疗费用相对会高。因为一线城市的医疗成本较高，挂号费、检查费、手术费等都可能比其他地区高。比如在上海、北京的三甲医院，单纯切开引流术可能也要5000元以上，复杂性肛周脓肿手术费用可能达到20000元左右。二线城市及以下： 二线城市及以下的医院，肛周脓肿的治疗费用相对低一些。单纯切开引流术可能在3000~6000元，复杂性肛周脓肿手术费用可能在10000~15000元左右。不过不同医院的收费标准也会有一定差异，需要具体咨询当地医院。
患者自身情况的影响
病情严重程度： 肛周脓肿病情越严重，治疗费用越高。如果肛周脓肿范围很大，已经波及多个间隙，需要更复杂的手术操作和更长时间的治疗，费用自然就会增加。而病情较轻的肛周脓肿，治疗相对简单，费用也就相对较低。是否有基础疾病： 如果患者本身有糖尿病等基础疾病，在治疗肛周脓肿时，需要同时控制基础疾病，这会增加治疗成本。比如糖尿病患者需要严格控制血糖，可能需要额外的检查和药物费用来维持血糖稳定，从而导致肛周脓肿的整体治疗费用升高。