卵巢巧克力囊肿的治疗方法主要包括以下几种：
1.药物治疗：
假孕疗法：通过使用孕激素，使子宫内膜发生类似妊娠的变化，停药后发生退行性变，类似月经来潮，使异位内膜剥落，起到治疗作用。
假绝经疗法：使用促性腺激素释放激素激动剂，通过抑制垂体功能，造成体内雌激素水平下降，出现暂时性绝经，使异位内膜停止生长，发生萎缩退化。
2.手术治疗：
保守性手术：保留卵巢功能的手术，包括卵巢巧克力囊肿剔除术、电凝术等。适用于年轻、有生育要求的患者。
半根治性手术：即全子宫及双侧附件切除术，适用于年龄较大、无生育要求的患者。
3.其他治疗：
介入治疗：通过血管介入的方法，将药物直接注入卵巢巧克力囊肿内，使囊肿缩小或消失。
中医治疗：中医认为卵巢巧克力囊肿的发生与血瘀有关，可采用活血化瘀、软坚散结的中药进行治疗。
需要注意的是，卵巢巧克力囊肿的治疗方法应根据患者的年龄、症状、生育要求等因素综合考虑。在治疗过程中，患者应遵医嘱进行定期复查，以便及时调整治疗方案。此外，患者还应注意生活方式的调整，保持良好的心态，有助于疾病的康复。