如果在性行为40天后使用验孕棒仍测不出怀孕，可能有以下原因：
1.验孕棒使用不当：验孕棒的正确使用方法很重要。如果使用方法不正确，可能会导致结果不准确。建议按照验孕棒的说明书正确操作。
2.验孕棒过期或质量问题：验孕棒如果过期或保存不当，可能会影响其准确性。建议使用有效期内的验孕棒，并妥善保存。
3.受孕时间较短：虽然性行为40天，但受孕时间可能较短，尿液中的人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平还不够高，无法检测出来。可以等待几天后再进行测试，或者去医院进行血液检查，以确定是否怀孕。
4.内分泌失调：某些情况下，内分泌失调可能会影响验孕棒的结果。例如，多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等疾病可能导致激素水平异常，从而影响验孕棒的准确性。
5.其他因素：某些疾病、药物、压力、情绪等因素也可能影响验孕棒的结果。例如，某些疾病如卵巢早衰、子宫内膜异位症等，某些药物如孕激素类药物等，都可能导致验孕结果不准确。
需要注意的是，验孕棒的结果并不是绝对准确的，有时可能会出现假阳性或假阴性的情况。如果对验孕棒的结果有疑虑，或者怀疑自己可能怀孕，建议及时去医院进行检查。医院通常会进行血液检查，以确定是否怀孕，并且可以更准确地确定受孕时间。
此外，如果是在备孕期间，建议保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、保持良好的心态等，有助于提高受孕的机会。如果有任何不适或疑虑，应及时咨询医生的意见。