男科全身检查的费用会受到多种因素影响。首先是检查项目，包括体格检查（100元到500元，评估一般健康状况和生殖器官外观、手感等）、血常规检查（50元到200元，了解贫血、炎症和感染等情况）、尿常规检查（30元到100元，用于评估泌尿系统功能和检测潜在问题）、前列腺抗原（PSA）检查（50元到200元，评估前列腺健康）、生殖系统超声检查（200元到500元，观察和评估生殖器官结构和功能）、泌尿系统CT或MRI检查（500元到2000元，了解泌尿系统解剖结构和发现潜在问题）、性激素检查（100元到500元，评估性激素水平）以及其他特殊检查如睾丸超声、阴囊彩超等（100元到500元，评估睾丸、阴囊等部位异常）。其次是医院级别和当地消费水平，普通医院或诊所费用可能较低，而三甲医院或专业男科医院且当地消费水平高时费用会相应增加。一般来说，男科全身检查总费用可能在500元到3000元之间，但具体需根据检查项目、医院级别和当地消费水平具体评估。建议在进行全面检查前咨询医生了解具体检查项目，选择医院时询问清楚相关费用并根据自身情况选择合适医院和检查项目。
总之，男科全身检查费用受多种因素综合影响，要结合具体情况来确定。