有心管搏动后仍有可能发生胎停，有研究显示，孕早期有心管搏动的情况下，胎停的发生率约为5% - 10%。
胚胎自身因素导致胎停
染色体异常：胚胎自身染色体出现数目或结构的异常是导致胎停的常见原因。即使已经出现有心管搏动，胚胎仍可能因为染色体异常无法正常发育，最终发生胎停。比如在一些自然流产的胚胎中，约50% - 60%存在染色体异常情况。基因缺陷：胚胎基因存在缺陷也会影响其正常发育，即便已经能观察到有心管搏动，后续仍可能因为基因缺陷无法维持正常妊娠而出现胎停。
母体因素引发胎停
内分泌失调：母体内分泌功能异常会影响胚胎发育。例如，甲状腺功能减退，若孕妇甲状腺素分泌不足，就会影响胚胎的生长发育，增加胎停的风险。研究发现，甲状腺功能减退的孕妇发生胎停的概率比甲状腺功能正常的孕妇高。自身免疫性疾病：像系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，会使母体的免疫系统攻击胚胎，导致胎停。患有自身免疫性疾病的孕妇，即使已经看到有心管搏动，胚胎也可能因为免疫系统的异常攻击而无法继续正常发育。
环境及其他因素影响
不良生活习惯：孕妇长期吸烟、酗酒，或者接触过多的放射性物质、化学毒物等，都可能导致胎停。比如孕妇每天吸烟超过10支，发生胎停的风险会明显增加。子宫环境异常：子宫畸形、子宫肌瘤等子宫环境异常情况，会影响胚胎的着床和发育。例如，子宫黏膜下肌瘤会影响子宫内环境，使胚胎着床后难以正常发育，即使已经有心管搏动，也可能出现胎停。