霉菌性阴道炎常用抗真菌药物治疗，一般规范用药能取得较好疗效。比如外用的克霉唑制剂，通常用药后数天内症状可改善。
外用抗真菌药物
克霉唑制剂：有克霉唑栓、克霉唑乳膏等。克霉唑栓一般是阴道给药，通过抑制真菌细胞膜合成发挥作用，通常每晚1粒，塞入阴道，连用7日左右能有效抑制霉菌生长。硝酸咪康唑制剂：常见的有硝酸咪康唑栓、硝酸咪康唑乳膏等。硝酸咪康唑栓阴道给药，每日1次，每次1粒，连用7日，它能干扰真菌细胞代谢过程，达到抗真菌效果。
口服抗真菌药物
氟康唑：属于全身用抗真菌药，通过抑制真菌细胞色素P450依赖酶，阻碍真菌细胞膜合成来发挥作用。一般单次口服150毫克即可，但需要注意，孕妇禁用氟康唑。伊曲康唑：也是口服抗真菌药，采用冲击疗法，即每日2次，每次200毫克，连用1日，不过肝功能异常者要慎用伊曲康唑，需在医生评估后使用。
特殊人群用药注意
孕妇：孕妇患霉菌性阴道炎时，外用药物相对更安全，如克霉唑制剂可在医生指导下谨慎使用，而口服抗真菌药物需格外谨慎，因为口服药可能对胎儿有潜在影响，必须由医生权衡利弊后决定是否使用及选择合适药物。糖尿病患者：糖尿病患者容易并发霉菌性阴道炎，除了规范使用抗真菌药物治疗外，还需要积极控制血糖，因为高血糖环境有利于霉菌生长繁殖，只有将血糖控制在合理范围，才能提高霉菌性阴道炎的治疗效果并减少复发，一般建议将空腹血糖控制在7mmol/L以下，餐后血糖控制在10mmol/L以下。