威灵仙可能存在一些副作用，比如消化系统方面，部分人服用后可能出现胃部不适，像胃痛、恶心等情况，发生率大概在5% - 10%左右。
消化系统方面的副作用
胃部不适： 有些人服用威灵仙后会出现胃痛的症状，这可能是因为威灵仙对胃黏膜有一定的刺激作用。还有些人会感觉恶心，甚至少数人可能出现呕吐的情况。一般来说，这种消化系统的不适症状在停药后可能会逐渐缓解，但如果症状比较严重，就需要及时就医处理。食欲减退： 部分患者服用威灵仙后会出现食欲下降的情况，吃得比平时少，长期可能会影响营养的摄入。不过这种情况相对胃部不适来说发生率可能稍低一些，但也需要关注。
过敏反应方面的副作用
皮肤过敏： 个别人群可能对威灵仙过敏，服用后会出现皮肤瘙痒的症状，皮肤表面可能会起红疹，严重的还可能出现风团样的皮疹。如果过敏反应较轻，可能只是局部皮肤的表现；但如果过敏反应较重，可能会全身皮肤都有症状，并且可能伴有发热等全身不适。呼吸道过敏： 极个别情况下，服用威灵仙后可能会出现呼吸道的过敏症状，比如打喷嚏、鼻塞、流涕，严重时可能会影响呼吸，出现呼吸急促的情况。一旦出现呼吸道过敏症状，情况比较危急，需要立即采取急救措施。
对神经系统的影响
头晕： 有少数人服用威灵仙后会出现头晕的症状，感觉头部昏沉，走路时可能会有不稳的情况。这种头晕症状的严重程度因人而异，有些可能只是轻微的不适，不影响正常活动；但有些可能会比较明显，影响日常生活和工作。乏力： 部分患者服用威灵仙后会感觉身体乏力，没有精神，想睡觉，活动耐力下降。比如平时能走一段较长距离的路，服药后可能走一小段就感觉很累，需要休息。不过一般这种乏力症状在停药后会逐渐减轻和消失。