结肠炎的治疗药物需根据病情类型等因素来定，一般来说，氨基水杨酸制剂是常用的，像柳氮磺吡啶，对于轻中度的溃疡性结肠炎有一定疗效，它能在肠道内分解出磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制炎症介质的产生。
氨基水杨酸制剂类
柳氮磺吡啶： 适用于轻、中度溃疡性结肠炎，它通过在肠道内分解发挥作用，能缓解炎症症状。但部分人服用后可能出现恶心、呕吐等胃肠道反应。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂，有多种剂型，如肠溶片等。对于结肠炎患者，它可以局部作用于肠道炎症部位，减轻炎症反应，副作用相对柳氮磺吡啶可能较小，不过也可能有腹泻、头痛等不适。
糖皮质激素
泼尼松： 对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中重度活动性结肠炎患者可使用。它能快速减轻炎症反应，但长期使用可能会有较多副作用，像骨质疏松、血糖升高、感染风险增加等。一般开始剂量为每日30 - 60毫克，然后根据病情逐渐调整。氢化可的松： 可用于急性发作期的重症结肠炎患者，通常通过静脉给药，能迅速发挥抗炎作用，但同样长期使用有较多不良反应，需密切监测。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的结肠炎患者。它通过抑制免疫系统发挥作用，起效相对较慢，一般需要数月才能看到明显效果。使用过程中要定期监测血常规等指标，因为可能会引起白细胞减少等血液系统问题。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于结肠炎的治疗，同样存在可能导致骨髓抑制等不良反应，用药期间需定期复查相关指标。