深呼吸时肺部疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.胸部损伤：如肋骨骨折、胸骨骨折、胸壁挫伤等，可导致深呼吸时肺部疼痛。
2.肺部疾病：如肺炎、肺结核、肺癌等，可引起肺部炎症或肿瘤，导致深呼吸时肺部疼痛。
3.心脏疾病：如心绞痛、心肌梗死等，可引起胸部疼痛，深呼吸时可加重。
4.胸膜炎：胸膜炎可导致胸膜炎症，深呼吸时可引起疼痛。
5.神经痛：肋间神经炎、带状疱疹等可引起神经痛，深呼吸时可加重。
6.其他：如肌肉劳损、肋软骨炎等，也可导致深呼吸时肺部疼痛。
如果出现深呼吸时肺部疼痛，建议及时就医，进行相关检查，如胸部X线、CT、心电图等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在就医前应注意休息，避免剧烈运动和深呼吸，以免加重疼痛。对于疼痛明显的患者，可在医生的指导下使用止痛药缓解症状。