怀孕右侧卵巢有包块主要有以下两种情况：
一、生理性的囊肿：
1.单纯的囊肿：如果患者孕前未发现附件区囊性包块，仅在孕后才发现，有可能是这种情况，它通常与排卵有关，只需定期复查。
2.黄体囊肿：排卵后形成，若没有腹腔内出血及严重腹痛，无需特殊处理。随着怀孕时间的推移，黄体囊肿可能会逐渐消失，既不会影响宝宝发育，也不会影响孕妇健康。
二、巧克力囊肿：也可能是其他性质的包块，比如巧克力囊肿。建议到妇科就诊并进行肿瘤标志物检查。如果肿瘤标志物结果正常且包块直径小于5厘米，建议孕期定期产检，产后复查即可。但若出现异常增大或腹痛，考虑是囊肿扭转或是破裂时，则需要给予手术治疗。
总结概况提示：怀孕时右侧卵巢有包块可能是生理性囊肿或巧克力囊肿，要根据具体情况判断和处理，如定期复查或必要时手术治疗等。