治疗疱疹常用的药物有抗病毒药物等，其中阿昔洛韦是常用的有效药物之一，一般可以在发病后24-48小时内开始使用能取得较好效果。
口服抗病毒药物
阿昔洛韦： 属于嘌呤核苷类似物，能干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒复制。对于初发的生殖器疱疹等，有一定疗效，能缩短病程、减轻症状。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，口服后在体内转化为阿昔洛韦发挥作用。生物利用度比阿昔洛韦高，服用相对方便，效果也较好，能有效缓解疱疹相关症状。
外用抗病毒药物
阿昔洛韦乳膏： 局部外用可治疗单纯疱疹、带状疱疹感染。直接涂抹在疱疹患处，能在局部发挥抗病毒作用，减轻疱疹引起的疼痛、促进愈合等。使用时要注意清洁患处皮肤，然后薄薄涂抹一层。喷昔洛韦乳膏： 对单纯疱疹病毒，尤其是Ⅰ型和Ⅱ型有抑制作用。适用于口唇或面部单纯疱疹、生殖器疱疹等，涂抹后能在局部形成药物膜，持续发挥抗病毒效果。
辅助药物
止痛药： 当疱疹引起明显疼痛时，可使用止痛药缓解。如对乙酰氨基酚，它能通过抑制前列腺素的合成发挥解热镇痛作用，一般适用于轻至中度疼痛的缓解，但要注意按照说明书或医嘱使用，避免过量。营养神经药物： 对于带状疱疹患者，有时会伴随神经痛，可使用甲钴胺等营养神经的药物。甲钴胺能参与一碳单位循环，在由同型半胱氨酸合成蛋氨酸的转甲基反应过程中起重要作用，有助于受损神经的修复，但使用时需遵循医生指导。