做有痛肠镜检查时会有一定程度的痛苦，但具体感受因人而异。一般来说，有痛肠镜检查过程中可能会让人感到腹部胀痛、牵拉感等不适，不过大多数人都能够耐受。
检查时的感受差异
个体差异影响：不同人对疼痛的耐受程度不同。年轻、身体状况较好且平时对疼痛耐受度高的人，感受可能相对没那么强烈；而本身对疼痛比较敏感、身体状态较差的人，可能会觉得更痛苦些。
检查前的准备影响感受
肠道清洁情况：检查前需要进行肠道清洁准备，如果肠道清洁不彻底，肠腔内有较多粪便等物质，在进镜过程中可能会增加操作难度，从而让受检者感受到更明显的不适。比如肠道清洁越好，进镜越顺利，痛苦相对可能就会轻一些。心理因素影响：紧张焦虑的情绪会放大对疼痛的感知。如果受检者在检查前过度紧张，会使得肌肉更加紧绷，这样在检查过程中就更容易感觉到疼痛等不适；而心态比较放松的人，相对来说感受可能没那么强烈。
检查中的操作因素
进镜过程：肠镜进镜时需要通过肛门进入肠道，在这个过程中，对于肠道弯曲部位的通过可能会引起腹部的胀痛等感觉。如果操作医生经验丰富、进镜手法熟练，可能会相对减少受检者的痛苦；反之，如果操作不熟练，进镜不顺利，就可能让受检者感受到更明显的痛苦。