口腔溃疡和口腔疱疹在发病原因、临床表现以及治疗方法上存在显著差异。具体如下：
一、发病原因：
1.口腔溃疡：其病因尚不明确，可能是免疫、遗传、微循环障碍、维生素缺乏、社会心理等多种因素综合作用的结果。
2.口腔疱疹：主要由单纯疱疹病毒感染引起，在机体免疫力低下时易复发，具有传染性，可通过飞沫、唾液及疱疹液直接接触传播，发病期间需注意隔离。
二、临床表现：
1.口腔溃疡：口腔黏膜会出现缺损样病变，病损多呈白色凹陷状，大小不一，周围黏膜常充血水肿，伴有疼痛，一般可自愈但易复发，全身症状通常不明显。
2.口腔疱疹：通常要经历四个时期。前驱期有病源接触史；潜伏期会出现发热、头痛、乏力、肌肉酸痛等全身症状；水疱期口腔黏膜有成簇小水疱，针尖大小且疱液清亮；水疱溃破后进入糜烂期会引起大面积糜烂，如控制不佳可继发感染，具有自限性。
三、治疗方法：
1.口腔溃疡：主要采用局部治疗，如使用西地碘含片、复方利多卡因乳膏、西瓜霜等药物进行消炎、止痛并促进局部黏膜愈合。
2.口腔疱疹：主要运用阿昔洛韦等药物进行抗病毒治疗。
总的来说，口腔溃疡和口腔疱疹在多个方面有着明显不同，了解这些差异有助于准确诊断和恰当治疗。