手关节囊肿的去除方法主要有非手术治疗和手术治疗等。一般来说，较小的手关节囊肿可以先尝试非手术方法，而较大或影响功能的可能需要手术。
非手术治疗方法
按压法：
挤压破裂法：对于一些较小的手关节囊肿，可尝试用手挤压，使其破裂，让液体自行吸收。但这种方法有一定风险，操作时要注意无菌，避免感染。不过并非所有人都适合，比如囊肿位置特殊或患者自身情况不允许时就不适用。
穿刺抽液法：
抽取囊液并注射药物：医生可以用注射器将囊肿内的液体抽出，然后向囊内注射一些药物，如糖皮质激素等，以促进囊肿的愈合。一般抽取囊液后注射药物有一定效果，但可能需要多次治疗。通常抽取囊液后注射药物后，需要限制手部过度活动一段时间，大约1 - 2周，让局部组织更好地恢复。
手术治疗情况
适合手术的囊肿情况：
囊肿较大影响功能：如果手关节囊肿较大，已经明显影响到手部的正常活动，如屈伸受限等，这时候可能需要进行手术切除。一般来说，当囊肿直径超过1 - 2厘米，且对手部功能产生明显影响时，手术切除是比较好的选择。
手术切除的过程：
手术切除囊肿是在局部麻醉下进行，医生会将囊肿完整切除。手术相对简单，但也有一定的复发概率，大约在5% - 10%左右。术后需要注意伤口护理，保持伤口清洁干燥，避免感染。通常术后10 - 14天可以拆线，在拆线前后都要注意手部不要过度用力，防止伤口裂开。
日常注意事项
避免过度使用手部：
无论是采用非手术还是手术治疗，在恢复期间都要注意避免手部过度使用。比如长时间打字、握持重物等。一般建议在囊肿治疗后的1 - 3个月内，尽量减少手部的剧烈活动和过度劳累。如果是从事需要频繁使用手部工作的人，在恢复期间可能需要调整工作方式。
观察囊肿变化：
即使经过治疗，也要注意观察手关节囊肿是否有复发等情况。如果发现手部再次出现类似囊肿的症状，如肿胀、疼痛等，要及时就医。一般建议在治疗后的1个月、3个月、6个月分别进行复查，通过体检、超声等检查手段来观察手部情况。