母亲有乙肝，孩子即便出生打了疫苗，仍有部分孩子可能会有乙肝。这主要是由于乙型肝炎病毒感染存在母婴传播的可能，且孩子体内的乙型肝炎表面抗体主动免疫应答存在差异。
一、携带乙型肝炎表面抗原的母亲生下的孩子，其对乙肝疫苗的免疫应答会受到一定抑制，而且抑制的程度会因疫苗种类不同而有所变化。孩子刚出生时、出生1个月以及出生半年各接种一次是较为理想的接种方案，不过即便如此，仍只有少数孩子会对疫苗无应答或者低应答，从而成为乙肝病毒易感人群或携带者。
二、此外，为降低乙型肝炎病毒的传播率，母亲在孕期需口服抗病毒药物，如替诺福韦等，孩子出生时要立即注射乙肝免疫球蛋白，并按计划接种乙肝疫苗。
总之，对于母亲有乙肝的情况，要重视孩子的预防措施，但即便采取了相关措施，仍不能完全避免孩子感染乙肝的风险。