肛门湿疹的治疗需综合多方面因素，一般可通过外用药物、内服药物以及日常护理等方式来改善。通常可以使用糖皮质激素乳膏等外用药物来缓解症状，比如氢化可的松乳膏等，能起到抗炎、止痒的作用，但使用时间一般不宜过长，以免产生不良反应。
外用药物选择
糖皮质激素乳膏： 像氢化可的松乳膏，具有抗炎、抗过敏的作用，能减轻肛门湿疹引起的瘙痒、红肿等症状。不过，面部、腋下等皮肤薄嫩处要谨慎使用，且连续使用一般不宜超过2周。钙调磷酸酶抑制剂： 如他克莫司软膏，适用于不宜使用糖皮质激素的部位，像肛周皮肤，它可以调节局部免疫反应，缓解湿疹症状，而且相对来说不良反应较少。
内服药物治疗
抗组胺药物： 氯雷他定片可以缓解肛门湿疹引起的瘙痒症状，它能竞争性阻断组胺H1受体，从而减轻过敏反应导致的瘙痒。成人一般每天服用1次，每次1片（10毫克）。但服用后可能会有嗜睡等不良反应，驾驶车辆或操作机械者需注意。抗生素： 如果肛门湿疹伴有感染情况，可能需要使用抗生素，比如头孢克肟分散片等。它对多种细菌有抑制作用，不过使用前需要确认患者是否对头孢类药物过敏。
日常护理要点
保持肛周清洁干燥： 每天要用温水清洗肛周，清洗后要轻轻擦干，保持局部干燥。清洗时水温不宜过高，一般30~40℃比较合适，避免刺激肛周皮肤。避免搔抓： 搔抓会加重皮肤损伤和瘙痒程度，尽量克制自己不要搔抓肛周皮肤，可以通过轻轻拍打等方式来缓解瘙痒。注意饮食： 要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能会加重肛门湿疹的症状；也要少吃海鲜等易过敏食物，以防过敏引发湿疹加重。