甲状腺炎的治疗方法需根据不同类型来定。一般来说，亚急性甲状腺炎可采用非甾体抗炎药缓解疼痛等症状，比如阿司匹林，约有半数左右的亚急性甲状腺炎患者通过短期使用非甾体抗炎药能改善症状。
亚急性甲状腺炎的治疗
药物缓解疼痛： 非甾体抗炎药如布洛芬，能减轻亚急性甲状腺炎引起的甲状腺部位疼痛、发热等症状，不过要注意胃溃疡患者需谨慎使用。激素治疗情况： 对于疼痛明显、体温较高，非甾体抗炎药效果不佳的患者，可考虑使用糖皮质激素，如泼尼松，能快速缓解症状，但使用时要密切关注激素的副作用，像可能引起血糖升高、骨质疏松等问题。
自身免疫性甲状腺炎的治疗
观察随访为主： 慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病）如果甲状腺功能正常，一般只需定期随访，每6 - 12个月复查甲状腺功能和甲状腺超声，监测病情变化。甲状腺功能减退时的处理： 当出现甲状腺功能减退，TSH升高时，需要补充左甲状腺素钠片，将甲状腺功能维持在正常范围，不过要根据个体情况调整药物剂量。
化脓性甲状腺炎的治疗
抗感染治疗： 化脓性甲状腺炎主要是细菌感染引起，需要使用敏感的抗生素进行抗感染治疗，比如根据药敏试验选择青霉素类或头孢类抗生素，一般需要用药2 - 4周左右，要足量足疗程使用抗生素控制感染。引流情况： 如果形成脓肿，可能需要进行脓肿引流，通过穿刺或切开引流排出脓液，促进炎症消退。