人乳头瘤病毒（HPV）感染的治疗需根据具体情况而定。对于大多数低危型HPV感染引起的良性病变，如尖锐湿疣，可通过多种方法处理。一般来说，低危型HPV导致的尖锐湿疣，可采用物理治疗等方式，像冷冻治疗可能在1-2周左右看到初步效果。
物理治疗方法
冷冻治疗： 通过低温使病变组织坏死脱落。通常医生会用液氮等冷冻剂直接接触疣体，可能需要多次治疗，间隔时间一般为2-3周，具体次数因人而异，取决于疣体的大小和数量。激光治疗： 利用激光的高能量烧灼疣体，使其清除。治疗后创面需要注意护理，防止感染，恢复时间大概在1-2周，治疗时要避免损伤周围正常组织。
药物辅助治疗
外用药物： 有一些局部外用药物可用于辅助治疗，比如鬼臼毒素酊，它能抑制HPV感染细胞的分裂增殖，从而起到去除疣体的作用，但使用时要注意避免接触正常皮肤，且孕妇禁用。还有咪喹莫特乳膏，它可以调节局部免疫，刺激机体产生抗病毒蛋白来对抗HPV，但起效相对较慢，一般需要连续使用几周。
自身免疫清除情况
大部分女性感染低危型HPV后，自身免疫系统可在数月到2年左右清除病毒，只有少部分会持续感染并引发病变。对于高危型HPV感染，若引起宫颈病变，轻度病变有一定概率通过自身免疫力恢复，中重度病变则需要根据具体情况进行如宫颈锥切等治疗，但这不属于直接针对HPV的抗病毒治疗，而是针对病变的处理。同时，要定期进行HPV复查和相关检查，如TCT（液基薄层细胞学检测），以便及时发现病变进展情况。