新生儿头上有个凹陷，可能是以下原因导致：
一、生理性凹陷：
1.新生儿出生后头部骨骼尚未发育成熟，会有前囟和后囟这两种生理性凹陷，这是正常现象，无需特殊处理。
2.随着生长发育，前囟和后囟会逐渐闭合。
3.家长要注意避免经常用手触摸凹陷处。
二、产道挤压：
1.经阴道娩出的新生儿，分娩时头部可能受到产道挤压而出现不同程度的头颅变形。
2.若没有异常症状，通常可随生长发育恢复正常，家长持续观察即可。
3.但若出现前囟门张力明显增高、易激惹等表现，需考虑颅内受到损伤，要进一步完善颅脑CT检查等以明确病因，然后采取对症治疗。
三、缺钙：
1.若钙摄入不足或钙吸收障碍，可能影响骨骼发育，会出现颅骨软化、枕秃、夜惊、入睡困难等症状。
2.需进一步完善微量元素检测。
3.明确病因后，建议在医生指导下给新生儿服用葡萄糖酸钙口服液、乳酸钙颗粒等药物进行治疗，同时家长要加强喂养。
除上述原因外，还可能与颅脑先天发育异常有关，建议查明原因后进行治疗，以免影响新生儿身体健康。