儿童肛门痛可能由多种原因引起。比如，常见的肠道寄生虫感染就是原因之一，像蛲虫感染，孩子夜间睡觉时，蛲虫会爬到肛门周围产卵，刺激肛门就会导致疼痛，这种情况在儿童群体中并不少见。
肠道寄生虫感染导致
蛲虫感染： 蛲虫一般是通过接触传播的，孩子可能在玩耍后不注意洗手，就会将蛲虫卵吃进肚子里。蛲虫在肠道内发育，到了夜间，雌虫会爬出肛门产卵，从而引起肛门周围剧烈瘙痒和疼痛，尤其在夜间更为明显。蛔虫感染： 蛔虫寄生在肠道内，当蛔虫数量较多或者活动时，也可能影响肠道功能，偶尔会导致肛门周围不适疼痛。
肛周局部皮肤问题
尿布疹： 如果孩子长时间使用不透气的尿布，或者更换尿布不及时，肛门周围皮肤就容易受到尿液、粪便的刺激，引发尿布疹，出现发红、疼痛的情况。尤其是对于0~2岁经常使用尿布的幼儿来说，这是比较常见的原因。肛周湿疹： 孩子的肛周皮肤比较娇嫩，如果局部潮湿、过敏等，容易引发肛周湿疹，表现为肛门周围皮肤红斑、丘疹、瘙痒、疼痛等症状。
肛肠疾病
肛裂： 儿童如果大便干结、排便困难，在排便时过于用力，就可能导致肛管皮肤裂开，引起肛门疼痛，同时还可能伴有便血。比如有些孩子因为挑食，蔬菜水果摄入少，大便干结，就容易出现肛裂导致肛门痛。肛周脓肿： 这是一种肛周组织的化脓性感染，孩子肛门周围会出现红肿、疼痛，触摸时疼痛明显，严重的还可能伴有发热等症状。不过相对来说，肛周脓肿在儿童中发病率没有前面几种原因那么高，但也是导致肛门痛的一个原因。