小肚子疼腰疼可能由多种原因引起，其中包括妇科炎症、痛经、尿路感染等，也可能有其他因素，如膀胱炎、输尿管结石等，需及时就医详细检查以明确病因并进行治疗。
一、妇科炎症：
这通常是因不洁性生活或不良卫生习惯致细菌侵入而引发。当患有妇科炎症时，往往会出现腹部疼痛，且会牵连到腰部疼痛。针对此，可在医生指导下使用如头孢克肟胶囊、甲硝唑片、阿奇霉素分散片等药物来进行治疗。
二、痛经：
一般是由于心理压力较大或久坐致使血液循环变差，经血运行不畅从而引起痛经，导致患者有腹痛、腰痛等症状。对此，可遵医嘱通过元胡止痛片、益母草颗粒、布洛芬缓释胶囊等药物予以治疗。
三、尿路感染：
多由革兰阴性杆菌感染导致，因炎症刺激常会引起腰部疼痛并伴有腹部疼痛。这时可在医生指导下使用头孢呋辛酯片、盐酸环丙沙星片、诺氟沙星胶囊等药物进行医治。
总之，当出现小肚子疼腰疼的情况时，应尽快明确病因，然后根据具体情况采取合适的治疗措施。