抗过敏药有多种，不同类型的抗过敏药副作用有所不同。一般来说，常见抗过敏药的副作用如下：
中枢神经系统方面的副作用
嗜睡表现： 第一代抗组胺药较易引起嗜睡，比如氯苯那敏，大约有10%-20%的人服用后会出现明显嗜睡症状，影响日常活动，像开车、操作机械等需要高度集中注意力的情况就不适合服用这类有明显嗜睡作用的抗过敏药。兴奋表现： 少数人服用某些抗过敏药后可能出现兴奋、失眠的情况，尤其是儿童对药物的反应可能更敏感，个别儿童服用后会变得烦躁不安、难以入睡。
心血管系统方面的副作用
心悸情况： 部分人服用抗过敏药后可能出现心悸症状，比如个别服用异丙嗪的患者可能会感觉心跳加快、心慌，不过这种情况相对较少见，发生率大概在1%-5%左右。血压影响： 有些抗过敏药可能会影响血压，比如少数人服用某些抗组胺药后可能出现血压轻度波动，不过一般对于正常血压人群影响不大，但对于本身有高血压等基础疾病的人需要密切观察血压变化。
消化系统方面的副作用
胃肠道不适： 常见的有恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，比如服用西替利嗪时，约有2%-5%的人可能出现胃肠道不适，表现为恶心，个别人可能会呕吐。食欲影响： 个别抗过敏药可能会影响食欲，导致服药后食欲减退，不过这种情况发生概率相对较低，一般在1%左右。
其他方面的副作用
眼部不适： 少数人使用抗过敏眼药时可能出现眼部刺激症状，比如滴用色甘酸钠眼液后，个别人可能会有眼部刺痛、烧灼感等，发生率较低，约为0.5%左右。局部反应： 外用的抗过敏药膏有时可能引起局部皮肤刺激，如涂抹糠酸莫米松乳膏后，个别人可能出现局部灼热感、瘙痒加重或皮肤干燥等，一般停药后可缓解。