孕早期孕妇注射肝素的作用主要包括预防血栓、防止流产，还能促进长胎心、胎芽，但在一些特定情况下可能无法发挥相应效果。
一、注射肝素能预防血栓和防止流产。孕期孕妇血液常处于高凝状态，易出现血栓、血小板增多、D-二聚体增高等情况，还可能有反复流产或胎停。注射肝素可预防血栓形成，增加子宫血运，减少子宫缺血、缺氧，进而有利于胚胎发育，帮助长胎心、胎芽。
1.通过注射肝素，能改善子宫的血氧状况，为胚胎发育创造更好的环境。
2.其可降低因子宫缺血、缺氧而导致的不良后果。
二、在胚胎质量不佳、出现胚胎停育时，注射肝素不能促使长胎心、胎芽。若胚胎本身存在染色体异常、生殖器畸形等问题，导致胚胎发育不良、流产率较高，即便注射肝素，作用也不明显。
(1)当胚胎质量存在根本问题时，肝素难以改变不良结局。
(2)某些严重的先天缺陷会限制肝素发挥作用。
三、若孕早期存在严重躯体应激或精神创伤，注射肝素对胎心、胎芽生长无明显促进作用。比如有手术、直接撞击腹部、同房过频等严重躯体应激，或过度紧张、焦虑、恐惧、忧伤等精神创伤，都可能影响胎心、胎芽生长，且仍可能导致难免流产。
(1)外界因素引发的不良影响，肝素难以有效解决。
(2)精神方面的不良状况会对胚胎发育产生不利。
总之，孕早期孕妇要注意多方面的问题，保持放松心情，多休息，避免过度劳累和同房，还应定期到医院产检，以保障胎儿的健康发育。同时要认识到，肝素虽然在一些情况下有重要作用，但并非万能，具体情况需综合判断和分析。