鼻窦炎的药物治疗需根据病情来选择，一般可以用抗生素、鼻用糖皮质激素等药物。通常急性细菌性鼻窦炎可能会用到抗生素，比如青霉素类的阿莫西林等，不过具体用药要遵医嘱。
抗生素类药物
细菌感染引起的鼻窦炎：如果是细菌感染导致的鼻窦炎，常用抗生素来治疗。像青霉素类的阿莫西林，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而起到杀菌作用。但要注意，对青霉素过敏的人不能用。还有头孢菌素类，如头孢克肟，也是通过干扰细菌细胞壁合成发挥抗菌功效，不过同样要避开过敏人群。
鼻用糖皮质激素
减轻鼻腔炎症：鼻用糖皮质激素能减轻鼻腔炎症反应。例如糠酸莫米松鼻喷雾剂，它可以减少鼻腔黏膜的水肿、充血，缓解鼻塞、流涕等症状。一般成人使用时按照说明书正确操作，不过儿童使用要在医生指导下，因为不同年龄段用量可能有差异。
黏液促排剂
促进黏液排出：黏液促排剂能促进鼻窦内黏液排出，改善鼻窦的通气引流。像桉柠蒎肠溶软胶囊，它可以调节黏液分泌，并刺激黏膜纤毛运动，帮助黏液排出。服用时一般用温水送服，不过孕妇和哺乳期女性使用要咨询医生。
减充血剂
缓解鼻塞：短期使用减充血剂能缓解鼻塞症状，比如麻黄碱滴鼻液，但这类药不能长期用，否则可能引起药物性鼻炎。因为长期使用会导致鼻黏膜反跳性充血，加重鼻塞情况，而且儿童使用要谨慎，避免出现不良反应。