自身免疫性脑炎是一种较为复杂的神经系统疾病，其临床表现多样。一般来说，自身免疫性脑炎患者可能会出现精神行为异常，约有一半左右的患者会有不同程度的精神症状，比如胡言乱语、行为怪异等；还可能出现癫痫发作，大约三分之一的患者会有癫痫表现，发作形式多样；另外，认知功能障碍也是常见表现之一，患者可能出现记忆力减退、注意力不集中等情况。
精神行为异常表现
情绪和认知改变：部分患者会出现情绪的大幅波动，比如原本性格温和的人变得易激惹，容易因为小事大发雷霆。同时认知方面也会有变化，对时间、空间的感知出现障碍，可能搞不清现在是白天还是晚上，不知道自己身处何地。幻觉与妄想：有些患者会出现幻觉，比如看到不存在的东西，听到不存在的声音；还可能产生妄想，坚信自己被某些人或者势力监视、迫害等。
癫痫发作表现
全面性发作：这是比较常见的癫痫发作类型之一，患者会出现全身抽搐、意识丧失的情况，发作时双眼上翻、口吐白沫，持续时间一般在1 - 3分钟左右。部分性发作：又可分为单纯部分性发作和复杂部分性发作。单纯部分性发作时患者身体某一局部或者一侧肢体出现强直、阵挛性发作，历时短暂，意识清楚；复杂部分性发作则会出现不同程度的意识障碍及明显的思维、知觉、情感和精神运动障碍，可能有自动症表现，如反复咀嚼、舔唇、搓手等无意识动作。
认知功能障碍表现
记忆力减退：患者对近期发生的事情遗忘明显，比如刚说过的话、刚做过的事很快就记不起来了，严重影响日常生活和工作学习。注意力不集中：患者很难长时间集中注意力去做一件事情，比如看书时很快就走神，不能持续专注于阅读内容，导致学习和工作效率大幅下降。