血清碱性磷酸酶偏低可能由多种原因引起。一般来说，血清碱性磷酸酶的正常参考值因检测方法和人群有所不同，成人血清碱性磷酸酶正常范围通常在40~150U/L之间，儿童可能会更高一些。
营养不良导致
蛋白质摄入不足： 如果长期蛋白质摄入过少，会影响身体的正常代谢，进而可能引起血清碱性磷酸酶偏低。比如一些挑食、节食过度的人群，长期缺乏足够的蛋白质供应，就容易出现这种情况。维生素缺乏： 像维生素C、维生素D等缺乏也可能与之相关。维生素D参与钙的代谢等过程，若缺乏维生素D，会影响骨骼的正常代谢，可能导致血清碱性磷酸酶偏低。例如一些素食者如果没有合理补充维生素D，就有发生维生素D缺乏的风险。
肝脏疾病影响
肝硬化： 肝硬化患者的肝脏功能受到严重损害，肝细胞代谢等功能异常，可能会出现血清碱性磷酸酶偏低的情况。肝硬化是一种慢性进行性肝病，由一种或多种病因长期或反复作用形成的弥漫性肝损害。肝炎： 某些类型的肝炎在病情发展过程中，也可能出现血清碱性磷酸酶偏低。例如重型肝炎患者，肝脏细胞大量受损，其合成等功能受到影响，进而影响血清碱性磷酸酶的水平。
甲状腺功能减退因素
甲状腺激素分泌不足： 甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，会影响身体的新陈代谢速度。甲状腺激素对身体的多种代谢过程都有调节作用，其分泌不足会导致包括血清碱性磷酸酶在内的多种指标发生变化，出现偏低的情况。甲状腺功能减退是由于甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低的一种疾病。
其他情况所致
慢性肾炎： 慢性肾炎患者的肾脏功能受到损害，身体的内环境平衡被打破，也可能影响血清碱性磷酸酶的水平。慢性肾炎是指蛋白尿、血尿、高血压、水肿为基本临床表现，起病方式各有不同，病情迁延，病变缓慢进展，可以不同程度肾功能减退，最终将发展为慢性肾衰竭的一组肾小球病。贫血问题： 严重的贫血患者，身体的各项代谢等功能受到影响，也可能出现血清碱性磷酸酶偏低的现象。例如缺铁性贫血患者，由于血红蛋白不足，携氧能力下降，影响身体多个器官组织的功能，进而可能导致血清碱性磷酸酶异常。