男人阴茎根部瘙痒可能由多种原因引起，以下是一些常见的因素：
1.真菌感染：如股癣、脚气等，可能会导致阴茎根部瘙痒。此外，念珠菌感染也可能引起阴茎炎，导致瘙痒、红肿等症状。
2.细菌感染：常见的有细菌感染性龟头炎，多由包茎或包皮过长导致，此外，不注意局部卫生、内裤过紧等也可能导致细菌滋生，引起阴茎根部瘙痒。
3.过敏反应：使用某些清洁剂、避孕套或避孕膏等可能导致过敏反应，从而引起阴茎根部瘙痒。
4.寄生虫感染：阴虱感染可导致阴毛部位瘙痒，搔抓后可引起皮肤破损，导致感染。
5.其他原因：湿疹、银屑病、扁平苔藓等皮肤疾病，糖尿病、黄疸等全身性疾病，以及心理因素等也可能导致阴茎根部瘙痒。
如果出现阴茎根部瘙痒，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓，以免加重症状或引起感染扩散。在治疗期间，应避免性生活，以免传染给伴侣。