新生儿拉肚子可能是消化不良、肠道菌群失调、肠炎等原因导致的。以下是根据不同原因的具体用药治疗情况：
一、消化不良：新生儿消化能力相对较弱，容易出现消化不良进而引起拉肚子。可采用以下药物进行治疗：
1.四磨汤口服液：能帮助改善消化功能。
2.蒙脱石散：可起到止泻作用。
3.双歧杆菌：有助于调节肠道菌群。
二、肠道菌群失调：肠道内有害细菌增多可能引发拉肚子。可使用如下益生菌药物，比如：
1.布拉氏酵母菌。
2.枯草杆菌二联活菌颗粒：配合蒙脱石散等药物来止泻。
三、肠炎：肠道受到细菌感染会导致拉肚子，治疗药物有：
1.头孢克洛颗粒。
2.蒙脱石散。
3.布拉氏酵母菌等。如果腹泻比较严重，还需静脉滴注补充葡萄糖、氯化钾等，以防止脱水和电解质紊乱。
以上所有用药都需要在医生的指导下进行，切不可自行随意用药。
总结提示：新生儿拉肚子的原因多样，用药需谨慎，要严格遵循医生指导，根据具体病因选择合适的药物进行治疗，同时要注意防止脱水和电解质紊乱等情况发生。