疟疾通常会有典型的周期性症状，一般感染后10~15天开始出现症状。
典型的周期性发作症状
寒战期：患者会突然感觉很冷，甚至打哆嗦，皮肤苍白，口唇、指甲发绀，寒战持续约10分钟到2小时。这是因为疟原虫在红细胞内大量繁殖，导致红细胞破裂，释放出毒素等物质，刺激人体体温调节中枢，引起寒战。高热期：寒战之后体温迅速上升，可达39℃甚至更高，患者面色潮红，头痛、全身酸痛，高热持续约2~6小时。此时是疟原虫在红细胞内繁殖导致大量红细胞破裂，释放的毒素等引起机体发热反应。大汗期：高热之后体温又突然下降，患者大量出汗，体温可降至正常或正常以下，大汗持续1~2小时。这是因为机体通过大量出汗来散热，以降低体温。
其他伴随症状
全身不适：在疟疾发作过程中，患者往往会感到全身乏力、疲倦，即使在缓解期也可能感觉身体不如平时。例如有些患者会觉得整天没什么力气，不想活动。胃肠道症状：部分患者会出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道不适症状。这是因为疟原虫感染引起的全身反应可能影响到胃肠道功能。比如有些患者会出现吃不下东西，吃了后容易呕吐，或者出现腹痛、腹泻的情况。贫血：长期反复发作的疟疾可能导致患者出现贫血症状，表现为面色苍白、头晕、心慌等。这是由于疟原虫破坏红细胞，导致红细胞数量减少，影响了氧气的运输。例如患者会经常感到头晕，尤其是在活动后，或者看东西有模糊的情况，同时面色看起来比较苍白。
脑型疟疾的特殊症状
对于儿童和免疫力低下的人群，可能会发展为脑型疟疾，除了上述典型的周期性症状外，还会出现神经系统症状，如头痛剧烈、烦躁不安、抽搐、昏迷等。脑型疟疾是比较严重的情况，因为疟原虫侵犯了脑部，影响了脑部的正常功能。比如患儿可能会出现反复的抽搐，意识不清，甚至陷入深度昏迷状态，这需要立即进行抢救治疗。