扁桃体发炎与咽炎在解剖部位、症状表现等方面有区别。扁桃体发炎主要是扁桃体部位的炎症，咽炎则是咽部黏膜等的炎症。
解剖部位差异
扁桃体位于口咽部两侧，咽炎涉及的咽部范围更广，包括鼻咽、口咽和喉咽等部位。
症状表现不同
扁桃体发炎时，扁桃体多明显红肿，甚至有脓性分泌物，咽痛较明显，可能伴有发热等；咽炎时咽部黏膜充血，咽痛相对较轻，可能有咽部异物感等不同表现。
致病因素有别
两者致病因素均多为病毒或细菌感染，但扁桃体发炎可能因扁桃体隐窝内细菌滋生等更易发病，咽炎可能与环境刺激等多种因素相关。
治疗要点差异
扁桃体发炎若为细菌感染，多需用抗生素等治疗；咽炎治疗需根据病因，如避免刺激因素等，感染时用药也与扁桃体发炎有所不同。对于儿童等特殊人群，患扁桃体发炎或咽炎时需更谨慎关注病情变化，及时就医，遵循医生建议进行处理，因为儿童免疫力等有其特点，病情变化可能较快。