巧克力囊肿是指异位的子宫内膜在卵巢内生长，伴随月经周期出血，形成含有陈旧性积血的囊肿。总体来说，巧克力囊肿较为严重，患者在发现后应遵循医生指导积极治疗，以防病情恶化。
巧克力囊肿的病因与症状如下：
一、病因：
1.目前巧克力囊肿的病因尚不明确。
2.可能与经血逆流、体腔上皮化生、家族遗传、体内雌激素水平异常、下生殖道梗阻、自身免疫性疾病等多种因素有关。
二、症状：
1.患者可能出现痛经症状，且疼痛程度往往较为剧烈。
2.会有性交痛的表现。
3.月经异常，比如经量增多、经期延长、经期前出血等情况。
4.可能导致不孕。
巧克力囊肿的治疗方法主要包括：
一、药物治疗：
1.药物治疗主要是为了抑制卵巢功能。
2.常用药物包括屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片、地诺孕素片等。
二、手术治疗：
1.手术的主要目标是切除病灶并恢复正常的解剖结构。
2.医生会依据患者的症状、病变部位、是否有生育需求等多方面因素，综合考量后选择适宜的手术方式。
以上所有用药都必须在医生的指导下进行，切不可自行用药。
总结概况提示：巧克力囊肿由异位子宫内膜所致，病因复杂且症状多样，治疗有药物和手术两种方式，用药需遵医嘱。