新生儿鹅口疮可以通过局部用药来治疗，常用的药物是2%碳酸氢钠溶液和制霉菌素混悬液。一般通过正确用药，能较快改善症状。
局部用药选择
2%碳酸氢钠溶液： 可以用棉签蘸取适量2%碳酸氢钠溶液，轻轻涂抹在新生儿口腔患处，每天涂抹数次。它能改变口腔内的酸碱环境，抑制白色念珠菌生长。制霉菌素混悬液： 将制霉菌素片研碎后加入适量无菌生理盐水配制成混悬液，然后用棉签涂抹在新生儿口腔的鹅口疮部位，能有效抑制白色念珠菌。
日常护理要点
哺乳器具清洁： 新生儿使用的奶瓶、奶嘴等哺乳器具要每天彻底清洁。可以用沸水烫洗奶瓶、奶嘴，至少烫洗5 - 10分钟，以杀死可能存在的白色念珠菌。母亲乳头清洁： 如果是母乳喂养，母亲要注意乳头的清洁。每次喂奶前后，可以用温水擦拭乳头，保持乳头的清洁卫生，防止白色念珠菌在乳头滋生后传染给新生儿。
预防复发措施
加强口腔卫生： 在新生儿鹅口疮治愈后，也不能放松口腔卫生。可以在每次喂奶后，给新生儿喂少量温水，起到清洁口腔的作用，减少食物残渣在口腔内滋生导致白色念珠菌复发的机会。增强免疫力： 新生儿自身免疫力较弱，要注意保暖等，避免新生儿生病。可以通过合理喂养等方式，为新生儿提供足够的营养，有助于增强其自身免疫力，降低鹅口疮复发的风险。