盐酸依匹斯汀胶囊可能存在一些坏处，比如部分人服用后可能出现嗜睡的情况，有研究显示约有2% - 5%的人用药后会出现困倦感。
神经系统方面的影响
头晕情况： 少数人服用盐酸依匹斯汀胶囊后可能出现头晕症状，一般来说出现的概率相对较低，但具体个体差异较大，有的患者可能在用药后较短时间内就感觉到头部昏沉不适。嗜睡表现： 如前面提到，有一定比例的人会出现嗜睡现象，这是因为该药物可能对中枢神经系统有一定影响，使得服用者精神状态受到抑制，从而容易产生想睡觉的感觉，在开车或者操作机械等需要高度集中注意力的活动前，应避免服用该药物，以免因嗜睡引发危险。
消化系统的相关反应
胃肠道不适： 部分人服用后可能出现胃肠道不适，像恶心就是比较常见的一种，有的患者可能会感觉胃部有不适的感觉，进而引发恶心的反应；还有些人可能出现呕吐症状，虽然相对恶心来说概率稍低，但也有发生的可能，表现为胃内容物从口中吐出。腹痛情况： 个别人群服用后会出现腹痛症状，腹痛的程度因人而异，有的可能只是轻微的腹部隐痛，有的可能相对较明显，但一般在停药后可能会逐渐缓解。
其他方面的不良影响
过敏相关表现： 虽然比较少见，但也有个别患者可能对盐酸依匹斯汀胶囊过敏，出现皮疹、瘙痒等过敏症状，皮疹可能表现为皮肤上出现红色的小丘疹等不同形态，瘙痒则会让患者感觉皮肤有明显的瘙痒感，影响生活质量。肝脏影响： 极少数情况下，可能对肝脏功能有一定影响，不过一般通过定期监测肝功能可以及时发现异常情况，比如可能会导致肝功能指标出现轻微的波动等，但总体发生概率较低。