药物流产本身不一定会绝对影响以后怀孕，但如果操作不当或术后恢复不好，可能会有一定影响。据临床统计，正规药物流产后，大部分女性仍可正常怀孕，但有少部分人可能出现一些问题。
药物流产的操作要点
药物流产一般是使用米非司酮联合米索前列醇，通过药物作用使胚胎排出。用药需在医生指导下进行，要确认是宫内妊娠且怀孕时间在49天内等符合药流的条件才能进行。
对以后怀孕可能产生的影响因素
宫腔感染方面
术后护理不当易感染：如果药物流产后没有做好私处卫生，比如没有每天清洗外阴、过早同房等，就容易引发宫腔感染。一旦发生宫腔感染，可能会导致子宫内膜炎等疾病，影响受精卵着床，进而影响以后怀孕。比如有研究发现，药物流产后发生宫腔感染的女性，再次怀孕时发生着床障碍的几率比没有感染的女性高约20%。感染程度不同影响各异：轻度的宫腔感染经过及时治疗，可能对以后怀孕影响相对较小；但如果感染比较严重，导致子宫内膜严重受损，就可能明显影响以后怀孕，甚至导致继发性不孕。
宫腔粘连方面
流产过程损伤内膜致粘连：药物流产时，胚胎排出过程中可能会对子宫内膜造成一定损伤，如果损伤严重就可能引起宫腔粘连。比如有部分女性药物流产后月经量明显减少，就可能提示有宫腔粘连的可能。粘连程度影响怀孕：轻度的宫腔粘连通过治疗后还有怀孕的机会，但如果宫腔粘连严重，会使宫腔容积减小，受精卵难以着床，大大降低怀孕几率，甚至导致不孕。
输卵管通畅方面
炎症蔓延致输卵管问题：药物流产后如果发生感染，炎症有可能蔓延到输卵管，导致输卵管发炎、堵塞等。输卵管是输送卵子和受精卵的重要通道，如果输卵管堵塞，精子和卵子无法相遇结合，就会造成不孕。据统计，药物流产后发生输卵管问题导致不孕的比例约为5% - 10%。及时检查很重要：女性药物流产后如果出现长期不孕的情况，需要及时去医院检查输卵管是否通畅等情况，以便早期发现问题并进行治疗。