甲亢变成甲减不一定意味着病情严重了，这可能是疾病发展过程中的不同阶段表现。比如在甲亢进行抗甲状腺药物治疗过程中，约有5% - 10%的患者会出现药物性甲减。
疾病发展阶段因素
甲亢变成甲减可能是疾病自然发展的一个过程。有些自身免疫性甲状腺疾病，如Graves病，在疾病的演变过程中，可能先表现为甲亢，随着病情发展，免疫系统对甲状腺的损伤持续，就可能逐渐出现甲减的情况。例如在疾病的后期，甲状腺滤泡被大量破坏，甲状腺激素释放减少，就会从甲亢状态转变为甲减状态。
治疗相关因素
抗甲状腺药物治疗
在甲亢患者接受抗甲状腺药物治疗时，药物剂量使用不当可能导致甲减。如果抗甲状腺药物剂量过大，就会过度抑制甲状腺激素的合成，从而使甲状腺功能从甲亢转为甲减。一般来说，在规范的抗甲状腺药物治疗过程中，医生会密切监测甲状腺功能，根据情况调整药物剂量，以尽量避免这种情况的过度发生。
放射性碘治疗后
甲亢患者接受放射性碘治疗后，也有发生甲减的风险。因为放射性碘会破坏甲状腺组织，随着时间推移，甲状腺合成甲状腺激素的能力逐渐下降，不少患者在放射性碘治疗后的数月至数年，会出现从甲亢向甲减的转变。通常在放射性碘治疗后的1年内，约有30% - 70%的患者会逐渐发展为甲减，之后每年甲减的发生率还会以2% - 5%的速度递增。
自身免疫因素影响
自身免疫性因素在甲亢转为甲减中也起到重要作用。自身抗体持续存在并不断损伤甲状腺，使得甲状腺的功能状态发生改变。例如在自身免疫性甲状腺炎相关的甲亢 - 甲减转变中，自身抗体攻击甲状腺细胞，先是导致甲状腺激素释放增加出现甲亢，随着甲状腺细胞不断被破坏，甲状腺激素分泌减少，就逐步出现甲减。而且这类患者往往需要长期关注甲状腺功能的变化，因为病情可能会反复波动，从甲亢转为甲减后可能还会有病情的其他变化。