中枢神经系统感染包含多种疾病，其中常见的有病毒性脑炎，据统计，病毒性脑炎约占中枢神经系统感染性疾病的10% - 20%。
病毒性脑炎
单纯疱疹病毒性脑炎：由单纯疱疹病毒引起，可侵犯大脑颞叶、额叶等部位，起病多较急，有发热、头痛、意识障碍等表现。肠道病毒性脑炎：由肠道病毒引起，如柯萨奇病毒、埃可病毒等，夏秋季多见，可通过消化道传播，常表现为发热、咽痛、皮疹伴中枢神经系统症状。
细菌性脑膜炎
肺炎链球菌脑膜炎：多见于儿童和老年人，肺炎链球菌可通过呼吸道入侵，进而累及脑膜，起病前常有上呼吸道感染等前驱症状。脑膜炎奈瑟菌脑膜炎：又称流脑，在儿童和青少年中多见，冬春季高发，主要通过飞沫传播，起病急，有高热、头痛、呕吐、皮肤瘀点瘀斑等表现。
真菌性中枢神经系统感染
新型隐球菌脑膜炎：较为常见，多见于免疫功能低下者，如艾滋病患者等，新型隐球菌多存在于鸽粪中，可经呼吸道吸入后播散至中枢神经系统，病程较长，有头痛、低热、视力障碍等表现。曲霉菌性中枢神经系统感染：多发生在免疫缺陷患者中，曲霉菌可通过血行播散等途径侵犯中枢神经系统，病情相对较重。
寄生虫性中枢神经系统感染
脑囊虫病：是猪肉绦虫幼虫囊尾蚴寄生于中枢神经系统引起的疾病，多因食用被虫卵污染的食物而感染，可出现癫痫发作、头痛、视力障碍等多种表现。脑型疟疾：由疟原虫感染引起，多见于疟疾流行区，患者有疟疾发作史，可出现头痛、呕吐、意识障碍等中枢神经系统受累表现。